SET SECURE: эта опция, будучи установлена в ON, должна усилить вашу защиту от непрошенного взлома путем запроса пароля на любое действие вне зависимости от того находится ли Ваш хост в ACCESS листе или нет.
При встрече NickServ выдаст вам сообщение:

-NickServ- This nickname is registered and protected. If it is your nickname,
           type /NickServ IDENTIFY password. Otherwise, please choose a different nickname.

Переименовывать Вас эта опция не будет, если Ваш хост присутствует в access list, даже если Вы так и не сообщите за 60 секунд ваш пароль.
Но, если вы воспользуетесь командой NickServ STATUS, то вы увидите, что в этом случае ваш статус будет

1 - user not recognized as nickname's owner.

Это означает, что NickServ не считает, что Вы вообще имеете к нему какое-либо отношение в данный момент. Проще говоря для сервиса NickServ вас нет в online. Для того, чтобы получить доступ к управлению вашим ником, получению статусов оператора на каналах через ChanServ и пр., вам придется обязательно выполнить команду NickServ IDENTIFY.